More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2446 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2446  malate dehydrogenase  100 
 
 		 491 aa  1015    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0296  malate dehydrogenase  56.58 
 
 		 489 aa  523  1e-147  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.491674 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0373  malate dehydrogenase  47.96 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.82 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2233  malate dehydrogenase  46.19 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.70342  normal  0.683923 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1691  malate dehydrogenase  45.84 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.145089  normal  0.0768004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0564  malate dehydrogenase  44.94 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0031  malate dehydrogenase  44.92 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399579  normal  0.119769 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0671  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  44.63 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1054  malate dehydrogenase  45.26 
 
 		 422 aa  375  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.767504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  42.58 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  38.63 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  41.99 
 
 		 411 aa  285  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  38.98 
 
 		 399 aa  286  9e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  38.42 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  41.08 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  38.41 
 
 		 399 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  39.58 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  39.95 
 
 		 383 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  37.94 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  38.16 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  37.94 
 
 		 409 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  38.16 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  38.75 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  36.6 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  36.6 
 
 		 414 aa  279  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  40.14 
 
 		 412 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  38.01 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  38.01 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  40.14 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  38.01 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  38.01 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  38.01 
 
 		 399 aa  276  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  39.48 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  36.92 
 
 		 414 aa  276  6e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  40.38 
 
 		 412 aa  276  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  40.14 
 
 		 412 aa  276  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  40.14 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  39.91 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  39.91 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  39.91 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  39.91 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  39.91 
 
 		 412 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  40 
 
 		 387 aa  273  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  39.39 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  39.71 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  40.43 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  40.43 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  38.89 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  36.36 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  37.83 
 
 		 478 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  37.91 
 
 		 478 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  37.32 
 
 		 752 aa  269  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  40.69 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  38.19 
 
 		 440 aa  268  1e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  38.08 
 
 		 439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  38.04 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  37.71 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  37.72 
 
 		 489 aa  266  7e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  40.55 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  37.66 
 
 		 387 aa  265  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  39.76 
 
 		 402 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  38.69 
 
 		 481 aa  263  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  35.21 
 
 		 757 aa  262  8e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  39.36 
 
 		 401 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  39.62 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  38.44 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  39.6 
 
 		 450 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  37.1 
 
 		 754 aa  259  7e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0241  transketolase A  41.87 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  40.99 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  40.99 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  39.52 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  36.79 
 
 		 503 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  39.52 
 
 		 376 aa  257  3e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4123  malate dehydrogenase  40.17 
 
 		 422 aa  257  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0085913  hitchhiker  0.00000090727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  40.7 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  37.28 
 
 		 474 aa  256  4e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  37.14 
 
 		 414 aa  257  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  38.74 
 
 		 769 aa  257  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  40.7 
 
 		 422 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0949  malate dehydrogenase  39.37 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  35.46 
 
 		 769 aa  256  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  37.16 
 
 		 466 aa  256  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  37.71 
 
 		 479 aa  256  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  35.68 
 
 		 760 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0810  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  37.77 
 
 		 414 aa  256  7e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  39.7 
 
 		 463 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  39.88 
 
 		 422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  37.66 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  39.25 
 
 		 759 aa  254  2.0000000000000002e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  37.72 
 
 		 424 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.031884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  37.8 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  38.08 
 
 		 470 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  34.66 
 
 		 759 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  36.07 
 
 		 751 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  39.28 
 
 		 780 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  36.59 
 
 		 751 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  36.39 
 
 		 422 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0896  malate dehydrogenase  39.39 
 
 		 381 aa  253  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.714122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>