55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1973 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1973  CvpA family protein  100 
 
 		 155 aa  286  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  31.4 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  30.83 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  32.77 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  32.11 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  27.59 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  29.57 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  30.17 
 
 		 234 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3486  colicin V production protein  32.29 
 
 		 232 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  24.49 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  27 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  30.91 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  26.36 
 
 		 213 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  27.03 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  27.82 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  30.17 
 
 		 162 aa  44.3  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4358  Colicin V production protein  28.78 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  31 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  27.07 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  19.72 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  19.72 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  28.57 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  29.41 
 
 		 208 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  27.78 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  29 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  29.41 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  30 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  27.19 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2634  Colicin V production protein  24.34 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105324  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  25.23 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  27.97 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  26.77 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  26.56 
 
 		 171 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  28.72 
 
 		 208 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  33.33 
 
 		 170 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  27.56 
 
 		 166 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  25.49 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  26.77 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  28.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  28.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  28.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  28.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  28.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1091  colicin V production protein  24.79 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.527466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  25.56 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  25.17 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  25.76 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  26.47 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>