32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0617 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0617  hypothetical protein  100 
 
 		 510 aa  997    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  30.06 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.69 
 
 		 773 aa  53.5  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 		 818 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  28.79 
 
 		 519 aa  51.6  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  27.82 
 
 		 626 aa  50.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 		 773 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.5 
 
 		 752 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 		 773 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.21 
 
 		 773 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.53 
 
 		 757 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 		 773 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  27.91 
 
 		 773 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  25 
 
 		 531 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  27.54 
 
 		 531 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.91 
 
 		 761 aa  47.4  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  29.05 
 
 		 734 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25 
 
 		 759 aa  47  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  24.62 
 
 		 604 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  27.7 
 
 		 708 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  30.37 
 
 		 843 aa  45.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 		 773 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.17 
 
 		 734 aa  45.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 		 772 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  22.4 
 
 		 474 aa  45.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  29.41 
 
 		 672 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.14 
 
 		 785 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  25.24 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  26.15 
 
 		 694 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1722  ComEC/Rec2-related protein  25.79 
 
 		 733 aa  43.5  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>