63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12213 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  70.83 
 
 		 145 aa  221  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  70.63 
 
 		 145 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  69.44 
 
 		 145 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  69.44 
 
 		 145 aa  199  9e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  68.75 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  51.75 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  48.61 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 145 aa  141  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  46.9 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  49.31 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  45.52 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  47.95 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  44.06 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  43.36 
 
 		 145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  42.36 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  45.14 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  43.75 
 
 		 148 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  43.06 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  40.69 
 
 		 147 aa  116  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  43.06 
 
 		 146 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  40.41 
 
 		 150 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  35.92 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  38.03 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  33.1 
 
 		 148 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  38.1 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  37.32 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  32.39 
 
 		 148 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  33.08 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  32.87 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  29.58 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  28.87 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  25.52 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  28.87 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  25.19 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  28.89 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  22.46 
 
 		 161 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  27.43 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  28.36 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  23.74 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  23.74 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  23.74 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  23.91 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  26.55 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  25.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2353  hypothetical protein  22.14 
 
 		 166 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719958  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2306  hypothetical protein  22.14 
 
 		 166 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121889  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2345  hypothetical protein  22.14 
 
 		 166 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0639664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1806  cyclase/dehydrase  26.43 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000623077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  23.45 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2853  cyclase/dehydrase  25.22 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>