More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2170 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2170  ferric uptake regulator family protein  100 
 
 		 149 aa  304  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.414225 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0987  ferric uptake regulator family protein  42.75 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00388915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1165  ferric uptake regulator family protein  39.57 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0381194  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0564  ferric uptake regulator  37.93 
 
 		 151 aa  105  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1789  ferric uptake regulator, Fur family  39.29 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.372499  normal  0.929582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1958  ferric uptake regulator family protein  38.52 
 
 		 170 aa  100  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0491085  hitchhiker  0.00899541 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3404  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 		 174 aa  97.4  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.092554  normal  0.327657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3952  ferric uptake regulator, Fur family  38.73 
 
 		 177 aa  94.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.873931 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  34.23 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06931  ferric uptake regulator family protein  34.23 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.247961  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06641  ferric uptake regulator family protein  34.23 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  34.23 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0870  ferric uptake regulator, Fur family  36.62 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0896  ferric uptake regulator, Fur family  36.62 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000149123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07451  ferric uptake regulator family protein  34.06 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0979772 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13391  hypothetical protein  32.89 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0077  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.88 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1775  ferric uptake regulator family protein  34 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.103697  normal  0.0302993 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1279  transcriptional regulator, Fur family  37.5 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000471651  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  37.88 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  37.12 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1315  transcriptional regulator, TrmB  32.39 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1295  ferric uptake regulator family protein  34.38 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000494544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07001  ferric uptake regulator family protein  32.56 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0209563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1364  ferric uptake regulator, Fur family  30.47 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 152 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  36.72 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1505  FUR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000456774  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2043  ferric uptake regulator family protein  29.5 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  27.46 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  27.46 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1198  ferric uptake regulator  33.82 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000281175  hitchhiker  0.000179243 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0603  ferric uptake regulator, Fur family  32.21 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  34.65 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5530  ferric uptake regulator family protein  35.11 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0869  ferric uptake regulator family protein  30.67 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  33.59 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1937  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1952  negative regulator of ferric uptake  30.22 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  34.62 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  32.56 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1641  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1716  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000280206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1716  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000468341  normal  0.147817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00640  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0211931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2954  ferric uptake regulator, Fur family  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000269107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0730  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0800  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00301514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  28.06 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0778  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000701006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0705  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000882448  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0752  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000171486  normal  0.37739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0567  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0711  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00631  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0172811  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2973  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00611688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0849  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000679753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0833  ferric uptake regulator  33.08 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1411  ferric uptake regulator family protein  30.15 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000449804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0740  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  31.58 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0813  ferric uptake regulator  33.09 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000465454  normal  0.444337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3966  ferric uptake regulator family protein  32.59 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.867334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2939  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0253838  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0987  ferric uptake regulator, Fur family  32.09 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.647798  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  33.09 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0873  ferric uptake regulator, Fur family protein  29.93 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1206  ferric uptake regulator  32.35 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000560641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3125  ferric uptake regulator  32.06 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  30.61 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1236  ferric uptake regulator  32.35 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000206726  normal  0.895859 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01339  ferric uptake regulator  32.82 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1690  ferric uptake regulator  31.82 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000286155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  30.53 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2145  ferric-uptake regulator  32.85 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2263  ferric uptake regulator  31.3 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1117  ferric uptake regulator, Fur family  30.88 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2902  ferric uptake regulator  32.35 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  28.87 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3097  ferric uptake regulator family protein  31.71 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  33.59 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2295  ferric uptake regulator family protein  29.08 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2991  ferric uptake regulator  32.35 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1434  ferric uptake regulator  29.58 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000031646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  30.53 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.86 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1481  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.268678  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0322  ferric uptake regulator  32.35 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2259  ferric uptake regulator, Fur family  29.58 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0544  ferric uptake regulator family protein  32.06 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0596927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>