274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1686 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1686  thiosulphate-binding protein  100 
 
 
341 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.863569  normal  0.139145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3492  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.69 
 
 
377 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4714  thiosulphate-binding protein  47.44 
 
 
381 aa  291  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.217544  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1722  thiosulphate-binding protein  46.2 
 
 
361 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2764  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.51 
 
 
361 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8377  normal  0.37323 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1681  thiosulphate-binding protein  42.14 
 
 
350 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0235432  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2750  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.87 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3352  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.87 
 
 
348 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.59657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3629  sulfate ABC transporter periplasmic sulfate-binding protein  41.4 
 
 
363 aa  266  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4715  thiosulphate-binding protein  44.16 
 
 
378 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.250615  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3454  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.52 
 
 
346 aa  264  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  43.14 
 
 
337 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  42.9 
 
 
336 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0044  thiosulphate-binding protein  41.72 
 
 
385 aa  249  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  42.77 
 
 
346 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.9 
 
 
329 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.91 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  41.91 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.91 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  41.18 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.25 
 
 
339 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.25 
 
 
339 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.48 
 
 
337 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42 
 
 
339 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.06 
 
 
356 aa  241  2e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1636  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.21 
 
 
345 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.778191  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.25 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  38.41 
 
 
327 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  39.4 
 
 
329 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.33 
 
 
341 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.87 
 
 
341 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0628  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.71 
 
 
335 aa  235  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  39.53 
 
 
331 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.72 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  37.69 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  40.13 
 
 
338 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  41.16 
 
 
337 aa  232  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  37.38 
 
 
329 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4739  thiosulphate-binding protein  43.56 
 
 
345 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0623695  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.01 
 
 
341 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  35.31 
 
 
329 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.94 
 
 
342 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2480  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  44.37 
 
 
345 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1629  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.81 
 
 
347 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482062  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1121  thiosulphate-binding protein  43.56 
 
 
345 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1601  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.56 
 
 
345 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  37.07 
 
 
329 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  37.07 
 
 
329 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1497  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.56 
 
 
345 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1517  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.56 
 
 
345 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.485355  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2013  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.89 
 
 
345 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1847  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.89 
 
 
345 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0806  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  43.89 
 
 
345 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0354  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  43.89 
 
 
345 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.271086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1861  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.89 
 
 
345 aa  229  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1773  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.09 
 
 
346 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.540986  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1698  sulfate/thiosulfate ABC transporter, sulfate-binding protein  43.89 
 
 
345 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0701208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1209  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.89 
 
 
327 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.527685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.91 
 
 
332 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  35 
 
 
329 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  37.74 
 
 
329 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1578  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  43.23 
 
 
345 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  40.66 
 
 
807 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.44 
 
 
337 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  34.69 
 
 
329 aa  227  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1572  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.33 
 
 
344 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  37.54 
 
 
329 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.14 
 
 
341 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  42.05 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.46 
 
 
343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1011  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  37.91 
 
 
351 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1196  sulfate ABC transporter, sulfate/thiosulfate-binding protein  37.91 
 
 
351 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1125  sulfate-binding protein  38.55 
 
 
351 aa  225  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.26 
 
 
332 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2844  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate- binding protein  38.96 
 
 
355 aa  225  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000416569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  38.69 
 
 
335 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3315  hypothetical protein  38.89 
 
 
328 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.227914  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  40.4 
 
 
332 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  38.7 
 
 
332 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  38.92 
 
 
335 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2855  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42 
 
 
339 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2940  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42 
 
 
363 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0581  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.3 
 
 
355 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2951  thiosulfate transporter subunit  36.87 
 
 
337 aa  222  6e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.339938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.82 
 
 
345 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  38.04 
 
 
332 aa  222  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  37.58 
 
 
335 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  37.13 
 
 
332 aa  222  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  39.18 
 
 
329 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  36.06 
 
 
337 aa  222  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  40 
 
 
798 aa  222  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0556  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  38.94 
 
 
349 aa  222  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3400  thiosulphate-binding protein  37.43 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0940818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>