20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2011 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  100 
 
 		 210 aa  395  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  73.76 
 
 		 210 aa  277  1e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  65.22 
 
 		 209 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  66.67 
 
 		 210 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  64.86 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  59.78 
 
 		 234 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  58.06 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  31.41 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  30.37 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  38.78 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  31.61 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  30.32 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  38.41 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  36.24 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  34.46 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  34.04 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0738  hypothetical protein  28.49 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3966  hypothetical protein  31.28 
 
 		 244 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  33.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3575  hypothetical protein  30 
 
 		 229 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>