22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1604 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1604  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  183  8e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0762  hypothetical protein  75.61 
 
 
83 aa  134  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.125216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08161  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  67.07 
 
 
83 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1886  hypothetical protein  56.79 
 
 
87 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06111  hypothetical protein  56.79 
 
 
87 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.46293 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05591  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  54.32 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3193  hypothetical protein  50.67 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.183625  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2642  hypothetical protein  42.17 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1979  hypothetical protein  46.84 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0913  hypothetical protein  37.04 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4341  hypothetical protein  45.57 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2649  hypothetical protein  56 
 
 
79 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0868  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40.51 
 
 
93 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1379  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1681  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.747789  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0848  hypothetical protein  34.62 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0556  hypothetical protein  28.21 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06121  hypothetical protein  26.92 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.428426  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05821  hypothetical protein  26.92 
 
 
79 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06201  hypothetical protein  31.58 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1245  4A-hydroxytetrahydrobiopterin dehydratase  34.33 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.361508  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8574  transcriptional coactivator/pterin dehydratase  40 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>