12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1073 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1073  cytochrome P460  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.177472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3074  cytochrome p460  70 
 
 		 203 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0890  hypothetical protein  64.05 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000843822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3706  hypothetical protein  40.24 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0132  hypothetical protein  39.87 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3707  hypothetical protein  30.19 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1074  cytochrome c, class I  28.19 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0131  cytochrome c, class I  27.42 
 
 		 329 aa  52.8  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.320568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1293  cytochrome c'  28.07 
 
 		 160 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00247418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2997  hypothetical protein  22.6 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308156  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2484  hypothetical protein  25.82 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331969  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1859  cytochrome c'  24.49 
 
 		 162 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.688648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>