16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0455 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0455  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1726  hypothetical protein  59.34 
 
 		 305 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978889 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4416  hypothetical protein  59.34 
 
 		 305 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3623  hypothetical protein  45.07 
 
 		 308 aa  276  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0834  hypothetical protein  29.3 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.430945  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1267  hypothetical protein  31.06 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3855  hypothetical protein  26.96 
 
 		 225 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2826  hypothetical protein  26.06 
 
 		 215 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.339437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0110  hypothetical protein  25.86 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2026  hypothetical protein  26.97 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.958277  normal  0.11175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003214  hypothetical protein  24.71 
 
 		 271 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2824  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.266593  normal  0.549163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2906  hypothetical protein  21.56 
 
 		 480 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2333  hypothetical protein  32.65 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.83902  normal  0.0456221 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03608  hypothetical protein  27.04 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002226  hypothetical protein  29.91 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>