116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0443 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0443  amino acid-binding ACT domain-containing protein  100 
 
 		 84 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.886591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4164  acetolactate synthase small subunit  73.97 
 
 		 86 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3613  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 85 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4030  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4008  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3933  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4346  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0363  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3663  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0357  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0423  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  59.15 
 
 		 85 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0290  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 89 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0346  amino acid-binding ACT domain-containing protein  57.14 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.550945  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3413  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  60.56 
 
 		 93 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03647  acetolactate synthase II, small subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4207  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03596  hypothetical protein  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0138992  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3986  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.196128  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4135  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.683239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4151  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5203  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  53.62 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4184  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.17 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4233  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.17 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.594626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4112  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.17 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4127  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.17 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4292  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.17 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0139  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  52.24 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4759  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50.68 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.722527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0155  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0483  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.242348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4060  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  50 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3775  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  49.25 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4014  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  49.28 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4031  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  48.53 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.612763  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0148  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  54.93 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4220  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  48.53 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0054  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  47.06 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0347  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.03 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002040  acetolactate synthase small subunit  39.71 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00411  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  38.24 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4844  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  39.71 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2489  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  38.24 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3280  acetolactate synthase 2 regulatory subunit  57.5 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2115  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2145  acetolactate synthase, small subunit  39.19 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.168594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00826  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0224  acetolactate synthase, small subunit  35.62 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.708645  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1241  acetolactate synthase, small subunit  37.5 
 
 		 179 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1989  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.62 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.609838  normal  0.244787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2980  acetolactate synthase, small subunit  38.03 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0119022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3022  acetolactate synthase, small subunit  38.03 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0809645  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001648  acetolactate synthase small subunit  35.21 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00890505  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12301  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.62 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0783462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1708  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  33.78 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.890134  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2035  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  40.85 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2257  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.8 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.21 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0122567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0625  acetolactate synthase, small subunit  32.39 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3436  acetolactate synthase, small subunit  32.89 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00183335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0671  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.62 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0328623  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1253  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.25 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.28788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1096  acetolactate synthase small subunit  39.44 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0282  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.78 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1935  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.43 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1852  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.43 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3490  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.43 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1124  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.23 
 
 		 171 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539849  hitchhiker  0.0000778154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1715  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  35.62 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1692  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  35.62 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1667  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  32.43 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0219  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.78 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.680597  normal  0.0364419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1850  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  38.03 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3652  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.49 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000715125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08471  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.21 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1320  acetolactate synthase, small subunit  30.99 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1556  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4448  acetolactate synthase, small subunit  33.8 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1967  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  35.62 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.742943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2457  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.49 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1889  acetolactate synthase 1 regulatory subunit  35.62 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0503  acetolactate synthase, small subunit  33.8 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.723319  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0764  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.39 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13311  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.88 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477847  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16041  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.39 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13461  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  32.88 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1234  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  34.78 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1967  acetolactate synthase, small subunit  33.33 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0353  acetolactate synthase, small subunit  35.21 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.648118  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1661  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  37.5 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2745  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.21 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8058  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  35.71 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1907  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1953  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1887  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.33 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00850496  normal  0.0767808 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0751  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  36.62 
 
 		 178 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2502  acetolactate synthase 3 regulatory subunit  33.8 
 
 		 163 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000850238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>