19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0310 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0310  integrase family protein  100 
 
 		 579 aa  1202    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 502 aa  68.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  28.16 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  26.85 
 
 		 342 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  24.76 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  23 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  23 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  23 
 
 		 517 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  28 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  31.5 
 
 		 337 aa  57  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  26.49 
 
 		 436 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  28.25 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  24.79 
 
 		 451 aa  54.3  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  27.88 
 
 		 526 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  61.11 
 
 		 1081 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.69 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  23.53 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  23.53 
 
 		 522 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>