47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2497 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2497  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  165  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  41.11 
 
 
1184 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  43.9 
 
 
1756 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  42.42 
 
 
935 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  44.71 
 
 
413 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  57.14 
 
 
717 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  58.14 
 
 
414 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2561  S-layer protein  32.43 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0213857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  51.11 
 
 
413 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  32.43 
 
 
461 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  32.43 
 
 
461 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  32.43 
 
 
461 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  32.43 
 
 
461 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.59 
 
 
558 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  31.08 
 
 
461 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0098  S-layer domain protein  47.73 
 
 
424 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  48.89 
 
 
552 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1597  S-layer-like protein region  46.81 
 
 
416 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.408429  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  51.16 
 
 
535 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  51.16 
 
 
535 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  48.84 
 
 
530 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  46.51 
 
 
754 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  46.51 
 
 
546 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  37.5 
 
 
431 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.13 
 
 
640 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  39.62 
 
 
506 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  54.84 
 
 
624 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  35.44 
 
 
880 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  35.21 
 
 
1226 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  42.59 
 
 
939 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  44.19 
 
 
282 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  37.74 
 
 
1821 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1771  S-layer domain-containing protein  32.47 
 
 
361 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.797057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  42.59 
 
 
914 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0975  S-layer protein EA1  43.18 
 
 
863 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000553738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3023  S-layer domain-containing protein  41.3 
 
 
408 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.80605  normal  0.105642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  30.88 
 
 
575 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  42.86 
 
 
521 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.06 
 
 
471 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  39.13 
 
 
223 aa  40.8  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  32.05 
 
 
862 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  32.05 
 
 
862 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  57.14 
 
 
573 aa  40.4  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1724  S-layer domain-containing protein  36.17 
 
 
441 aa  40.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000217367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0748  hypothetical protein  53.12 
 
 
388 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  41.86 
 
 
814 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  45.45 
 
 
693 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>