21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1290 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1290  accessory gene regulator B  100 
 
 
212 aa  430  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0386  Accessory gene regulator B  29.65 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3199  Accessory gene regulator B  28.64 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000122343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3428  Accessory gene regulator B  28.64 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1620  accessory gene regulator B  32.16 
 
 
210 aa  78.2  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1580  accessory gene regulator B  29.06 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406273  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0905  accessory gene regulator B  32.21 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.491294  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0909  accessory gene regulator B  26.77 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.291264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3687  Accessory gene regulator B  34.45 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2358  accessory gene regulator B  24.1 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000360105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0955  Accessory gene regulator B  27.27 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3079  Accessory gene regulator B  31.97 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000646617 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1813  putative accessory gene regulator protein B  25.63 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0195657  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0915  Accessory gene regulator B  26.2 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159504  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1532  accessory gene regulator protein B, putative  26.73 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0554255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0400  hypothetical protein  30.69 
 
 
102 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0500  accessory gene regulator B  27 
 
 
194 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000369213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01610  Accessory gene regulator B  28.78 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2798  Accessory gene regulator B  25.64 
 
 
210 aa  49.3  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000819807  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3455  Accessory gene regulator B  26.32 
 
 
188 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6127  major facilitator transporter  27.07 
 
 
435 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>