221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4903 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4903  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0639  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.198474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0659  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0783  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0866  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0871  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.433518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1017  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.700598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1491  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0660911  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1931  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1944  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1965  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2046  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2081  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2100  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2136  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2357  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0428135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2666  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0465233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2673  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2820  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2867  transposase IS3/IS911  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3087  putative transposase  80.99 
 
 		 124 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2330  transposase IS3/IS911  80.17 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.449623  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3113  transposase IS3/IS911  80.17 
 
 		 124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0869  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1144  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.731855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2408  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285932  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2434  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0591246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2864  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2880  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.301854  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2942  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.95779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3105  transposase IS3/IS911  78.51 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4623  transposase IS3/IS911 family protein  75.41 
 
 		 124 aa  191  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.453344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0835  transposase IS3/IS911  83.93 
 
 		 125 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.907814  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9079  transposase  74.59 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9019  transposase  74.59 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1263  transposase IS3/IS911  79.82 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6452  transposase IS3/IS911 family protein  79.17 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5452  transposase IS3/IS911 family protein  77.5 
 
 		 124 aa  182  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5506  transposase IS3/IS911 family protein  77.5 
 
 		 124 aa  182  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4140  transposase IS3/IS911  77.97 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3825  transposase IS3/IS911  74.6 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8059  transposase  73.77 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.877817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1298  transposase IS3/IS911  81.48 
 
 		 109 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5395  transposase IS3/IS911 family protein  83.33 
 
 		 99 aa  166  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2283  transposase IS3/IS911 family protein  61.4 
 
 		 134 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  normal  0.0121146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0887  transposase IS3/IS911 family protein  61.4 
 
 		 134 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2280  transposase IS3/IS911 family protein  61.4 
 
 		 134 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00249906  normal  0.0576324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2663  transposase IS3/IS911 family protein  61.4 
 
 		 134 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.333405  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5095  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.72528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2450  transposase IS3/IS911  92.98 
 
 		 57 aa  107  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.782064 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5091  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.774813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3959  transposase IS3/IS911  72.73 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.546667  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4724  transposase IS3/IS911  73.02 
 
 		 71 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.240633  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1261  transposase IS3/IS911  68.75 
 
 		 53 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3375  hypothetical protein  93.75 
 
 		 43 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422861  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3374  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3515  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3411  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.042682  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3275  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000360291  normal  0.033149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0678  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.505807  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3237  hypothetical protein  34.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0336824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3049  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 		 374 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1518  transposase IS3/IS911 family protein  43.75 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18320  hypothetical protein  39.33 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11483  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0054  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000565593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2173  transposase IS3/IS911  33.33 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  32.94 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  32.94 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  33.33 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  34.72 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0416  transposase IS3/IS911  32.43 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2321  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.588962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  34.12 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5484  transposase IS3/IS911 family protein  28.12 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2349  transposase IS3/IS911 family protein  37.65 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0590216  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5642  transposase IS3/IS911 family protein  28.12 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5449  transposase IS3/IS911 family protein  28.12 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.49737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  33.33 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0169  transposase IS3/IS911  33.01 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2107  transposase IS3/IS911 family protein  33.68 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000446311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  35.79 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2025  transposase IS3/IS911  32.04 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  35.48 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  33.72 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0590  transposase IS3/IS911  28.57 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.139932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  32.88 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6765  transposase IS3/IS911 family protein  35.71 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  35.48 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  35.48 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2414  transposase IS3/IS911 family protein  32.63 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0878  transposase IS3/IS911 family protein  32.63 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.921471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02439  hypothetical protein  29.03 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0065  transposase IS3/IS911 family protein  28.17 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>