15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3581 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  322  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  29.22 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  32.97 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2457  hypothetical protein  26.89 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0270573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  33.96 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3105  hypothetical protein  28.26 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.965221  normal  0.584323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2844  hypothetical protein  26.55 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00819039  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  25.21 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2430  hypothetical protein  29.13 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  26.72 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1692  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0506341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  28.1 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2011  hypothetical protein  26.61 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0066698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  23.89 
 
 		 141 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>