37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3174 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  67.42 
 
 		 92 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  54.12 
 
 		 224 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2539  hypothetical protein  53.09 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3042  hypothetical protein  43.68 
 
 		 97 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.152852 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4170  hypothetical protein  44.05 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  40.24 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  38.55 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5298  hypothetical protein  37.8 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  34.41 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  36.25 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  36.25 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  34.52 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  34.52 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  34.52 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  34.52 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  34.52 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  30 
 
 		 287 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  32.22 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  27.91 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  31.82 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  32.53 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  30.34 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 		 291 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  31.25 
 
 		 286 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  30.86 
 
 		 286 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  31.4 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  32.39 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  32.39 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  32.39 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 		 295 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  30.68 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  29.55 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  32.39 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  30.77 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.410943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>