51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2334 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2334  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0702679  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4051  hypothetical protein  56.14 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2738  hypothetical protein  50.91 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.67183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2024  hypothetical protein  54.55 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.418321  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3278  hypothetical protein  54.55 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.759532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3366  hypothetical protein  50.91 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467157  hitchhiker  0.00768256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2788  hypothetical protein  50.88 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2359  hypothetical protein  49.09 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.329968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1725  hypothetical protein  49.12 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327274  normal  0.493212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3110  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3001  hypothetical protein  55.36 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1245  hypothetical protein  63.64 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3862  hypothetical protein  50.91 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4171  protein of unknown function DUF1328  50.91 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5993  hypothetical protein  61.36 
 
 		 54 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4397  protein of unknown function DUF1328  49.12 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.522854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3429  hypothetical protein  46.43 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4322  protein of unknown function DUF1328  49.09 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01748  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2727  hypothetical protein  50.91 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1732  hypothetical protein  47.27 
 
 		 53 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.604004  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5991  protein of unknown function DUF1328  59.09 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5876  hypothetical protein  50.91 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6481  protein of unknown function DUF1328  59.09 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3570  hypothetical protein  54.55 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2720  hypothetical protein  54.55 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3821  protein of unknown function DUF1328  48.21 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2934  hypothetical protein  54.17 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0862761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10980  hypothetical protein  49.09 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0080  hypothetical protein  52.27 
 
 		 54 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2510  hypothetical protein  52.08 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0937034  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5092  hypothetical protein  53.49 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00404445  normal  0.354219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0151  hypothetical protein  53.49 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843759 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0135  hypothetical protein  53.49 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0153  hypothetical protein  53.49 
 
 		 53 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0536  hypothetical protein  43.64 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.217472  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0835  hypothetical protein  43.64 
 
 		 53 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1698  hypothetical protein  37.93 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0177  protein of unknown function DUF1328  56.52 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0654  hypothetical protein  43.64 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.450723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0263  hypothetical protein  38.18 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0044  hypothetical protein  48.84 
 
 		 54 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3728  hypothetical protein  48.21 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0419  protein of unknown function DUF1328  46.67 
 
 		 56 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2356  hypothetical protein  55.56 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1807  hypothetical protein  54.05 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0070  hypothetical protein  50.91 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.842765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0245  protein of unknown function DUF1328  45.45 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0548817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6731  protein of unknown function DUF1328  52.27 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1861  protein of unknown function DUF1328  51.11 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0562518  normal  0.109398 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3027  protein of unknown function DUF1328  49.12 
 
 		 58 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.171842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>