21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2265 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2265  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 98 aa  200  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.9 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.9 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.9 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.9 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.9 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.52 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.52 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.52 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2267  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.03 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4249  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.93 
 
 		 93 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  29.58 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  30.99 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  31.71 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.85 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>