More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1090 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1090  diacylglycerol kinase, catalytic region  100 
 
 
300 aa  604  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1713  hypothetical protein  36.42 
 
 
312 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0604892  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1835  diacylglycerol kinase catalytic region  35.76 
 
 
310 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00166325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6348  diacylglycerol kinase, catalytic region  35.92 
 
 
312 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2141  diacylglycerol kinase catalytic region  36.63 
 
 
311 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241813  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2943  putative lipid kinase  36.67 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0252  putative lipid kinase  31.88 
 
 
293 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2227  diacylglycerol kinase catalytic region  33.56 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1943  putative lipid kinase  34.84 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.282737  normal  0.0158542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2552  putative lipid kinase  32.31 
 
 
305 aa  129  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4941  putative lipid kinase  30.13 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454886  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1398  diacylglycerol kinase catalytic region  31.16 
 
 
310 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2791  putative lipid kinase  30.62 
 
 
326 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0686435  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5358  putative lipid kinase  33.12 
 
 
317 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.593577  hitchhiker  0.00311469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4111  putative lipid kinase  31.02 
 
 
317 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.135746 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0081  putative lipid kinase  29.01 
 
 
310 aa  122  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1607  diacylglycerol kinase catalytic region  31.19 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  31.19 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1567  putative lipid kinase  30.03 
 
 
309 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3848  diacylglycerol kinase catalytic region  30.74 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000041794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2179  putative lipid kinase  30.72 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.786183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2074  putative lipid kinase  32.78 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1486  putative lipid kinase  28.57 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1672  putative lipid kinase  29.22 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1846  putative lipid kinase  30.03 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3254  diacylglycerol kinase catalytic region  31.79 
 
 
300 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3510  putative lipid kinase  34.67 
 
 
297 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1023  putative lipid kinase  30.33 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0947788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3759  putative lipid kinase  31.15 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3667  putative lipid kinase  34.62 
 
 
314 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2853  hypothetical protein  31.56 
 
 
335 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1590  diacylglycerol kinase catalytic region  32.19 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.49251 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2891  diacylglycerol kinase catalytic region  31.15 
 
 
310 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  29.73 
 
 
364 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  28.8 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0967  hypothetical protein  30.82 
 
 
321 aa  99  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3598  putative lipid kinase  33.67 
 
 
297 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2178  diacylglycerol kinase, catalytic region  30.93 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1562  diacylglycerol kinase catalytic region  28.8 
 
 
297 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.11 
 
 
367 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  28.63 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1986  putative lipid kinase  28.06 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.520999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1952  putative lipid kinase  28.06 
 
 
315 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.669604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1436  putative lipid kinase  25.65 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7230  Sphingosine kinase-like protein  27.17 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1610  diacylglycerol kinase catalytic region  25.65 
 
 
287 aa  87.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4772  putative lipid kinase  29.11 
 
 
323 aa  87  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1766  hypothetical protein  28.67 
 
 
291 aa  87  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  26.84 
 
 
300 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  28.94 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  31.58 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  31.1 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  25.52 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  31.1 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2079  lipid kinase  27.12 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  25.52 
 
 
300 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  25.1 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3156  diacylglycerol kinase catalytic region  28.11 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324114  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  25.1 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  30.37 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  25.1 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2977  lipid kinase  27.86 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3900  diacylglycerol kinase catalytic region  30.56 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.377313  normal  0.188998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3562  lipid kinase  32.37 
 
 
305 aa  79  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3289  diacylglycerol kinase, catalytic region  28.75 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.169628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2484  lipid kinase  28.47 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1303  lipid kinase  27.5 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2125  lipid kinase  32.32 
 
 
295 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382632  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1455  hypothetical protein  26.92 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.435019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  31.76 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3628  putative lipid kinase  28.95 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.619357  normal  0.534231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0827  methylglyoxal synthase  25.98 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4345  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.04 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3616  lipid kinase  30.24 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2372  lipid kinase  28.14 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132584  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1734  diacylglycerol kinase catalytic region  28.34 
 
 
424 aa  75.5  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  29.88 
 
 
307 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1324  lipid kinase  30.24 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2283  lipid kinase  28.14 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2376  lipid kinase  28.14 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.367743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1207  lipid kinase  30.24 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2701  lipid kinase  31.25 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3095  lipid kinase  30.24 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00318455  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2441  diacylglycerol kinase catalytic region  28.85 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3102  diacylglycerol kinase, catalytic region  36.43 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2327  lipid kinase  28.14 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.317751  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0050  diacylglycerol kinase catalytic region  24.05 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0172  diacylglycerol kinase catalytic region  30.64 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2392  diacylglycerol kinase catalytic region  25.97 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>