26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35910  Flp pilus assembly protein TadB  100 
 
 		 282 aa  539  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4804  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.422865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4890  type II secretion system protein  36.26 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.830749  normal  0.078643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13688  transmembrane protein  35.98 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.76431e-37  normal  0.0719684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1385  type II secretion system protein  37.79 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0556186  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5406  type II secretion system protein  36.63 
 
 		 260 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0730  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  38.21 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.258746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5191  type II secretion system protein  38.64 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0306742  hitchhiker  0.000243657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0277  type II secretion system protein  46.08 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0519  Type II secretion system F domain protein  36.96 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3907  Type II secretion system F domain protein  41.18 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0127  putative integral membrane protein  34.72 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.215153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2776  hypothetical protein  46.59 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0377209  hitchhiker  0.0000127528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0051  integral membrane protein  48.48 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.741215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0593  hypothetical protein  42.48 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3160  hypothetical protein  39.82 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0670324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5869  hypothetical protein  38.61 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00430744  normal  0.104668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33350  hypothetical protein  36.56 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0215  type II secretion system protein  35.03 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4298  type II secretion system protein  38.54 
 
 		 448 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0121  hypothetical protein  32.11 
 
 		 191 aa  49.3  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5327  Type II secretion system F domain protein  34.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0528876  normal  0.372482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3371  hypothetical protein  39.47 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0620  hypothetical protein  36.56 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  28.11 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0481  Flp pilus assembly protein TadB-like protein  33.15 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>