63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24890 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  64.58 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  59.03 
 
 		 145 aa  176  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  53.1 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  52.41 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  54.86 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  52.08 
 
 		 153 aa  150  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  51.03 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  51.7 
 
 		 152 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  49.31 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  51.03 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 		 143 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  48.98 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  48.28 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  48.63 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  49.66 
 
 		 145 aa  133  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  46.9 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  48.97 
 
 		 145 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  44.9 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  46.53 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  39.58 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  37.59 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  37.76 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  37.76 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  35.42 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  37.06 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  34.97 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  41.26 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  35.66 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  36.36 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  34.27 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  31.29 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  31.51 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  30.61 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  29.93 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  29.93 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  30 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  29.01 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  25.17 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  26.62 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  30.97 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  30.2 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  25.71 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  24.65 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  26.53 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  30.09 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  30.2 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  30.09 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3174  hypothetical protein  23.57 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3105  hypothetical protein  30.43 
 
 		 423 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.112367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  24.83 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  22.38 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5816  cyclase/dehydrase  26.9 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0214868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  23.81 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>