32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  100 
 
 		 415 aa  833    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1228  protein of unknown function DUF324  30.32 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3212  hypothetical protein  22.68 
 
 		 443 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  23.04 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  25.05 
 
 		 597 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  24.5 
 
 		 513 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  33.66 
 
 		 594 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  37.61 
 
 		 622 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  26.27 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.14 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  28.57 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  30.28 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  29.95 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  28.82 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.94 
 
 		 260 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.01 
 
 		 237 aa  56.2  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1677  CRISPR-associated RAMP protein  21 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.71005  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  31.98 
 
 		 298 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1149  hypothetical protein  24.5 
 
 		 447 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0538158  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  27.27 
 
 		 338 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  21.38 
 
 		 474 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  20.22 
 
 		 472 aa  50.8  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  27.09 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.34 
 
 		 267 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.68 
 
 		 307 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  27.94 
 
 		 237 aa  46.6  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.03 
 
 		 249 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  25.99 
 
 		 257 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  26.63 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.1 
 
 		 282 aa  43.9  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  29.13 
 
 		 240 aa  43.1  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  30.77 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>