121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04490  acyl carrier protein  100 
 
 		 87 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21129 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  43.75 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1496  acyl carrier protein  40.62 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0493  acyl carrier protein  39.06 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0468  acyl carrier protein  40.62 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  37.31 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1866  acyl carrier protein  40 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00815396  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0285  acyl carrier protein  43.75 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0975  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.553759  normal  0.616153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0894  acyl carrier protein  41.94 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0694526 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1096  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000417281  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  33.82 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0066  acyl carrier protein  38.33 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3498  acyl carrier protein  33.82 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503689  hitchhiker  0.00947262 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  33.82 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2298  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  34.67 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2397  acyl carrier protein  40.32 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.774036  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1644  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.28963  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1587  acyl carrier protein  36.67 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281743  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  32 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0561  acyl carrier protein  40.62 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1416  acyl carrier protein  35.29 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.28944  normal  0.571191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  32.35 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3831  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 78 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1602  acyl carrier protein  35 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00127335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1615  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.161415  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  37.1 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  37.1 
 
 		 78 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  34.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  28.21 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2133  acyl carrier protein  34.29 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000639035  normal  0.0269953 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3358  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.304425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1526  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  30.14 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1834  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103322  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  37.1 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4156  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0436  acyl carrier protein  33.87 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.20002  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  37.1 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  37.1 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1907  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000356515  hitchhiker  0.00000541151 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2666  acyl carrier protein  33.87 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1633  acyl carrier protein  27.03 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2874  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0334524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3247  acyl carrier protein  36.07 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  35 
 
 		 76 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  32.39 
 
 		 78 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1362  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.915786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1609  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000323844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 77 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0174  acyl carrier protein  30.65 
 
 		 80 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9709  predicted protein  35.38 
 
 		 71 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14468  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  35 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1090  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.343466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1491  acyl carrier protein  34.43 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  31.08 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14930  acyl carrier protein  30.88 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1345  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.095592  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  35 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0433  acyl carrier protein  28.99 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.145071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  37.29 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  31.34 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  30.88 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  30.88 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  31.34 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  30.88 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2462  acyl carrier protein  31.43 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0113419  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  28.17 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  28.17 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  35.48 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  32.2 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  35 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>