36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1068 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1068  hypothetical protein  100 
 
 
410 aa  850    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1829  hypothetical protein  42.2 
 
 
455 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121539  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2171  GTP-binding protein  42.2 
 
 
455 aa  320  3e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5873  hypothetical protein  34.63 
 
 
418 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0926  hypothetical protein  33.74 
 
 
419 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6215  hypothetical protein  33.9 
 
 
418 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4540  protein of unknown function DUF187  34.88 
 
 
427 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0126264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4407  protein of unknown function DUF187  34.88 
 
 
427 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2323  hypothetical protein  34.85 
 
 
461 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5606  hypothetical protein  35.06 
 
 
418 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278011  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1078  hypothetical protein  34.42 
 
 
463 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1361  hypothetical protein  34.42 
 
 
463 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2054  hypothetical protein  34.42 
 
 
463 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.48739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2344  hypothetical protein  34.42 
 
 
463 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.896177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3228  GTP-binding protein  34.67 
 
 
463 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1450  hypothetical protein  34.41 
 
 
619 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3112  hypothetical protein  34.42 
 
 
590 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2359  GTP-binding protein  32.84 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.609724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00830  hypothetical protein  35.76 
 
 
380 aa  209  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0051  hypothetical protein  34.2 
 
 
419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0513  hypothetical protein  33.23 
 
 
490 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2670  hypothetical protein  31.46 
 
 
680 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.750364 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0052  hypothetical protein  32.54 
 
 
419 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.115032  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0026  hypothetical protein  33.44 
 
 
607 aa  179  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0048296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3054  hypothetical protein  29.81 
 
 
681 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000100223  hitchhiker  0.00791247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2402  hypothetical protein  29.41 
 
 
443 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0964182  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2182  hypothetical protein  33.12 
 
 
666 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1192  hypothetical protein  25.36 
 
 
679 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000450505  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1139  hypothetical protein  30.27 
 
 
438 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000332623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24530  hypothetical protein  28.57 
 
 
504 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2056  hypothetical protein  31.96 
 
 
540 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00919079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  27.63 
 
 
693 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0164  hypothetical protein  30.23 
 
 
614 aa  116  6e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.0000289397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5916  hypothetical protein  26.02 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0573  hypothetical protein  33.76 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1171  hypothetical protein  46.15 
 
 
202 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>