19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0928 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  100 
 
 		 431 aa  882    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1898  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 458 aa  96.7  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1382  hypothetical protein  24.11 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2532  tetratricopeptide TPR_2  22.78 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  25.2 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3156  hypothetical protein  24.18 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2344  hypothetical protein  22.34 
 
 		 444 aa  67  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95942  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1557  hypothetical protein  23.16 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.4261e-20  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1126  hypothetical protein  17.66 
 
 		 442 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  30.11 
 
 		 160 aa  57  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0303  tetratricopeptide TPR_4  31.72 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 4079 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0587  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 1393 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.836601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  37.74 
 
 		 3301 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1324  hypothetical protein  31.13 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0130583 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  31.88 
 
 		 519 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 589 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>