15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3721 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3721  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4102  hypothetical protein  88.68 
 
 		 317 aa  460  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.374452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5195  hypothetical protein  59.27 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1393  integral membrane protein  34.55 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3359  putative integral membrane protein; putative transcription factor  38.77 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  0.535273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1314  hypothetical protein  40.91 
 
 		 286 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.735762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1331  hypothetical protein  40.91 
 
 		 286 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.800239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1350  hypothetical protein  40.91 
 
 		 286 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0609  hypothetical protein  34.87 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4404  hypothetical protein  34.62 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0285  twin-arginine translocation pathway signal  32.08 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4381  hypothetical protein  28.27 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0181  hypothetical protein  32.66 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5745  hypothetical protein  30.45 
 
 		 309 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445628  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0182  hypothetical protein  32.79 
 
 		 327 aa  42.4  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>