17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1679 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1679  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  850    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.882455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1673  hypothetical protein  82.34 
 
 		 418 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.595687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1894  hypothetical protein  68.27 
 
 		 413 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4260  hypothetical protein  29.41 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.50651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7163  hypothetical protein  26.61 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4993  hypothetical protein  25.64 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5213  hypothetical protein  27.29 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0312335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21860  hypothetical protein  24.8 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.218372  normal  0.0328594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2941  hypothetical protein  27.32 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3769  hypothetical protein  29.12 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.657962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2746  hypothetical protein  26.35 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000246717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2701  hypothetical protein  23.62 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000302317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  25.51 
 
 		 653 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  25 
 
 		 524 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3694  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1357 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5073  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1349 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.528473  hitchhiker  0.000168425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2246  hypothetical protein  22.49 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.421702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>