24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0309 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0309  peroxiredoxins-like protein  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0372  peroxiredoxins-like protein  91.94 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0337922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6166  hypothetical protein  70.83 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0651  hypothetical protein  69.17 
 
 		 120 aa  167  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0454  hypothetical protein  71.19 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0915  hypothetical protein  66.95 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.510132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2924  hypothetical protein  64.41 
 
 		 120 aa  158  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0470  hypothetical protein  66.67 
 
 		 120 aa  156  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4339  hypothetical protein  62.5 
 
 		 120 aa  153  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04950  predicted peroxiredoxin  61.86 
 
 		 127 aa  147  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4253  hypothetical protein  57.63 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0441  hypothetical protein  39.32 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.64264  normal  0.450906 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  29.46 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  28.81 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  31.53 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  29.36 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  29.66 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  31.9 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  30.25 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  31.58 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  33.64 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  22.69 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0639  DsrE family protein  27.43 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0564243 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  32.43 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.254553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>