39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1142 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  764    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  38.46 
 
 
367 aa  234  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  22.63 
 
 
373 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  24.24 
 
 
342 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2094  hypothetical protein  22.32 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0155004  normal  0.0950605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  20.75 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  22.83 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  20.05 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  21.69 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3538  hypothetical protein  23.79 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  19.17 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  22.65 
 
 
352 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  21.32 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0139  hypothetical protein  17.79 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4021  hypothetical protein  24.11 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000017114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  18.87 
 
 
404 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  19.93 
 
 
353 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  27.27 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3996  hypothetical protein  22.62 
 
 
397 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880784  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4016  hypothetical protein  23.39 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.620979 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  21.15 
 
 
374 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2734  hypothetical protein  22.97 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  19.46 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  20.11 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  19.37 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  21.04 
 
 
367 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  21.58 
 
 
374 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  18.6 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  19.29 
 
 
363 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  21.52 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5228  hypothetical protein  20.24 
 
 
383 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  24.83 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4042  hypothetical protein  23.98 
 
 
363 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00590442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  18.71 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  20.19 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  22.16 
 
 
377 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  21.51 
 
 
372 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  25.9 
 
 
377 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1142  hypothetical protein  21.78 
 
 
392 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.202037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>