27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0049 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0049  tRNA-Ile  100 
 
 		 86 bp  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0046  tRNA-Ile  97.37 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0047  tRNA-Ile  97.37 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0051  tRNA-Ile  94.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 101 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0057  tRNA-Ile  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.381014  normal  0.359244 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 112 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 106 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 118 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0056  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0029  tRNA-Ile  84.09 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0013  tRNA-Asp  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0034  tRNA-Asp  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0915271  hitchhiker  0.000000414345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.764712  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  91.18 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0008  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  91.18 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.319712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0029  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0035  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000342792  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.467617 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0070  tRNA-Ile  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.385957 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>