More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0671 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0671  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  100 
 
 
432 aa  877    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1054  malate dehydrogenase  66.18 
 
 
422 aa  573  1.0000000000000001e-162  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.767504  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0373  malate dehydrogenase  64.34 
 
 
448 aa  551  1e-156  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0031  malate dehydrogenase  60.92 
 
 
428 aa  530  1e-149  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399579  normal  0.119769 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0564  malate dehydrogenase  63.1 
 
 
434 aa  527  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1691  malate dehydrogenase  63.33 
 
 
434 aa  528  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.145089  normal  0.0768004 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2233  malate dehydrogenase  62.14 
 
 
434 aa  524  1e-147  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.70342  normal  0.683923 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.06 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2446  malate dehydrogenase  44.63 
 
 
491 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  46.82 
 
 
399 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  46.56 
 
 
399 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  46.56 
 
 
399 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  46.56 
 
 
399 aa  346  5e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  46.56 
 
 
399 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  46.56 
 
 
399 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  46.82 
 
 
399 aa  346  5e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  46.31 
 
 
399 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.1 
 
 
384 aa  346  6e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  45.5 
 
 
383 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  44.61 
 
 
407 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  47.7 
 
 
390 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47 
 
 
478 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.09 
 
 
478 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  47.57 
 
 
481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  49.59 
 
 
403 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  45.16 
 
 
414 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  43.78 
 
 
409 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  43.78 
 
 
409 aa  332  8e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.88 
 
 
411 aa  332  9e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  44.29 
 
 
414 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  44.29 
 
 
414 aa  332  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  44.96 
 
 
387 aa  331  2e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  46.1 
 
 
400 aa  330  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  47.22 
 
 
401 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  43.77 
 
 
390 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  44.16 
 
 
399 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  42.93 
 
 
409 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  49.63 
 
 
407 aa  326  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.47 
 
 
387 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  45.09 
 
 
414 aa  325  1e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.77 
 
 
489 aa  324  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.4 
 
 
392 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  45.11 
 
 
427 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  45.34 
 
 
412 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  45.83 
 
 
412 aa  322  6e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  45.83 
 
 
412 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  45.73 
 
 
755 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  46.19 
 
 
412 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  43.02 
 
 
771 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  43.85 
 
 
773 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  45.59 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  45.59 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  45.59 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  45.59 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  45.59 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  42.33 
 
 
771 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  45.79 
 
 
402 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  45.79 
 
 
402 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0147  malate dehydrogenase  46.83 
 
 
402 aa  317  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  47.15 
 
 
391 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0296  malate dehydrogenase  43.49 
 
 
489 aa  315  7e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.491674 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0896  malate dehydrogenase  46.59 
 
 
381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  43.7 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0158  malic enzyme  46.55 
 
 
764 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  43.18 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  44.78 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  47.04 
 
 
376 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  47.04 
 
 
376 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0949  malate dehydrogenase  46.48 
 
 
379 aa  312  9e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  44.17 
 
 
407 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  45.94 
 
 
474 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  42.22 
 
 
411 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  44.74 
 
 
467 aa  311  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  43.05 
 
 
771 aa  311  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  43.8 
 
 
390 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  46.75 
 
 
417 aa  311  2e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  44.53 
 
 
407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  42.19 
 
 
440 aa  310  5e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  43.62 
 
 
493 aa  310  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2955  malate dehydrogenase  46.75 
 
 
474 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3014  malic enzyme  41.44 
 
 
751 aa  308  8e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0241347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  45.83 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  40.81 
 
 
754 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  44.26 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3598  malic enzyme  42.68 
 
 
754 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4187  malate dehydrogenase  40.99 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  45.83 
 
 
474 aa  306  3e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  43.31 
 
 
780 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4423  malate dehydrogenase  42.09 
 
 
415 aa  307  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.15 
 
 
405 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  40.09 
 
 
783 aa  307  3e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.6 
 
 
399 aa  307  3e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3542  malic enzyme  42.71 
 
 
753 aa  307  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0471  malate dehydrogenase  46.89 
 
 
376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122448  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0048  malic enzyme  43.72 
 
 
761 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  42.82 
 
 
779 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1580  malic enzyme  43.07 
 
 
764 aa  306  6e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  44.84 
 
 
423 aa  305  7e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  42.48 
 
 
752 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2051  NADP-dependent malic enzyme, truncated  44.24 
 
 
413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>