43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3203 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1422  PfaB family protein  78.26 
 
 		 756 aa  1209    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2908  PfaB family protein  77.63 
 
 		 777 aa  1209    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3203  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  100 
 
 		 765 aa  1585    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2666  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  44.4 
 
 		 716 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1325  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  43.5 
 
 		 769 aa  522  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1418  PfaB family protein  42.68 
 
 		 757 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1424  PfaB family protein  44.07 
 
 		 725 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2930  PfaB family protein  43.18 
 
 		 760 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1452  PfaB family protein  43.25 
 
 		 749 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2841  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  42.09 
 
 		 754 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2667  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  39.63 
 
 		 768 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1220  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  41.6 
 
 		 697 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2734  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  40.23 
 
 		 756 aa  465  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2628  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  39.06 
 
 		 741 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1114  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  30.24 
 
 		 687 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3103  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  27.46 
 
 		 900 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1685  polyunsaturated fatty acid synthase PfaB  26.8 
 
 		 854 aa  186  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4450  PfaB family protein  26.53 
 
 		 917 aa  174  7.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3914  PfaB family protein  27.23 
 
 		 1107 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.51111  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2593  Beta-ketoacyl synthase  26.19 
 
 		 1109 aa  158  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4750  Beta-ketoacyl synthase  25.18 
 
 		 1605 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.607154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3102  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  27.33 
 
 		 2336 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2011  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  26.89 
 
 		 2348 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2114  Beta-ketoacyl synthase  26.11 
 
 		 2391 aa  138  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2104  Beta-ketoacyl synthase  26.62 
 
 		 2396 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1677  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  25.93 
 
 		 2376 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2268  Beta-ketoacyl synthase  29.74 
 
 		 2276 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5625  polyketide synthase  27.21 
 
 		 2368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3324  Beta-ketoacyl synthase  26.1 
 
 		 2275 aa  99.8  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4237  Beta-ketoacyl synthase  26.71 
 
 		 2882 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0689  polyketide synthase modules and related proteins-like  22.82 
 
 		 3073 aa  58.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665216 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08209  Conidial yellow pigment biosynthesis polyketide synthase (PKS)(EC 2.3.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q03149]  23.45 
 
 		 2157 aa  54.7  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3473  Erythronolide synthase  22.19 
 
 		 2314 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.715304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  26.51 
 
 		 3130 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7001  Beta-ketoacyl synthase  24.85 
 
 		 1658 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.39366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  23.17 
 
 		 2551 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1963  putative modular PKS system  22.17 
 
 		 2553 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00967187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  23.45 
 
 		 1909 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  23.93 
 
 		 2762 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2627  beta-ketoacyl synthase  22.5 
 
 		 2664 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  23.58 
 
 		 1470 aa  45.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  24.44 
 
 		 2176 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  23.46 
 
 		 3718 aa  44.3  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>