31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3094 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  69.71 
 
 		 208 aa  293  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  56.73 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  52.66 
 
 		 210 aa  225  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  52.17 
 
 		 210 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  52.17 
 
 		 210 aa  224  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  65.36 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  51.69 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  53.23 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  52.74 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  52.74 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  50.75 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  51.69 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  44.86 
 
 		 210 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  41.78 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  48.81 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  30.91 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  27.72 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  29.08 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  28.28 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  30.83 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  33.12 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  28.12 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  29.07 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  29.23 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2004  hypothetical protein  22.22 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.244808  hitchhiker  0.00247338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0826  hypothetical protein  29.2 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1731  hypothetical protein  26.28 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0892  hypothetical protein  28.07 
 
 		 342 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000863231 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3401  hypothetical protein  24.55 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>