42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8261 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8261  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0410012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6038  hypothetical protein  53.01 
 
 		 200 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1225  Conserved protein containing a Zn-ribbon-like protein motif possibly RNA-binding  55.21 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00786893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1454  protein of unknown function DUF1470  41.58 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6249  protein of unknown function DUF1470  35.81 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9196  protein of unknown function DUF1470  33 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0954  hypothetical protein  36.02 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1215  hypothetical protein  34 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0066  hypothetical protein  30.77 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47200  hypothetical protein  30.41 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1923  protein of unknown function DUF1470  32.43 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3273  hypothetical protein  36.22 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1908  protein of unknown function DUF1470  28.37 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.975753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4029  hypothetical protein  32.47 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.462167  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0139  hypothetical protein  26.02 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4844  hypothetical protein  26.09 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2325  hypothetical protein  28.49 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4335  hypothetical protein  31.33 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0777  hypothetical protein  39.71 
 
 		 186 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.25881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0220  hypothetical protein  32.77 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5067  hypothetical protein  38.81 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0212  hypothetical protein  33.61 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2397  protein of unknown function DUF1470  38.71 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.776458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26800  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  50 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4753  hypothetical protein  33.87 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5519  hypothetical protein  33.87 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5144  protein of unknown function DUF1470  45.45 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5342  hypothetical protein  33.87 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1226  protein of unknown function DUF1470  35.94 
 
 		 181 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0861  protein of unknown function DUF1470  46.67 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1030  hypothetical protein  37.7 
 
 		 176 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962986  normal  0.138179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1081  protein of unknown function DUF1470  35.94 
 
 		 181 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8882  hitchhiker  0.000010734 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14500  conserved protein containing a Zn-ribbon-like motif, possibly RNA-binding  40 
 
 		 188 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.111122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2488  protein of unknown function DUF1470  33.87 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1036  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.26369e-21 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11890  Protein of unknown function (DUF1470)  34.25 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1123  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0952  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0894  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4616  hypothetical protein  32.86 
 
 		 192 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0252967  hitchhiker  0.00238598 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0853  hypothetical protein  31.15 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2691  protein of unknown function DUF1470  28.71 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>