16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7767 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7767  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2695  hypothetical protein  49.41 
 
 		 255 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.452372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1989  hypothetical protein  39.43 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000215096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2537  NERD domain-containing protein  32.93 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.320376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8808  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7331  hypothetical protein  29.88 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1345  NERD domain protein  29.17 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.199042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2208  hypothetical protein  26.6 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3417  NERD domain protein  24.29 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.977584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4513  NERD domain protein  29.37 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0431453  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0235  hypothetical protein  28.95 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.27533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4510  hypothetical protein  44.64 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3664  hypothetical protein  29.46 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6631  NERD domain-containing protein  32.2 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3368  NERD domain protein  38.46 
 
 		 734 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4351  hypothetical protein  50 
 
 		 467 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.614415 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>