19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5297 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  307  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.04 
 
 		 477 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  49.04 
 
 		 306 aa  87  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  42.06 
 
 		 304 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  45.37 
 
 		 726 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  45.83 
 
 		 480 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  46.46 
 
 		 769 aa  79  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  44.79 
 
 		 342 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  41.12 
 
 		 269 aa  74.7  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  36.29 
 
 		 201 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  42.27 
 
 		 599 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  33.93 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  38.54 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  31.58 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7806  hypothetical protein  29.71 
 
 		 193 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  38.61 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  31.47 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0662721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5322  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5662  hypothetical protein  35 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>