20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1853 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1853  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0194223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6276  XRE family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.348728  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  37.9 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4666  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.223091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  43.64 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  36.9 
 
 		 111 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12303  hypothetical protein  20 
 
 		 491 aa  42  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  42  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>