28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1641 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1268    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  44.54 
 
 		 670 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  45.5 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  46.75 
 
 		 369 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  47.79 
 
 		 373 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  42.49 
 
 		 429 aa  226  8e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4584  glycosyl transferase family protein  48.56 
 
 		 546 aa  209  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  29.93 
 
 		 629 aa  109  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  32.9 
 
 		 641 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  31.49 
 
 		 694 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  28.8 
 
 		 617 aa  90.5  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  27.23 
 
 		 685 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  24.51 
 
 		 249 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23 
 
 		 317 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4105  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 		 317 aa  53.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.852576  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1247  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 259 aa  52.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  26.67 
 
 		 650 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  23.49 
 
 		 292 aa  47.4  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  26.54 
 
 		 321 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0608  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 		 262 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  26.15 
 
 		 671 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 382 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  25.21 
 
 		 740 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 324 aa  44.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0891  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 257 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0478  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 335 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  0.931373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2352  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 		 317 aa  43.9  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.164298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>