25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0656 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  36.78 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  35.95 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  33.53 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  33.63 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  34 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  33.13 
 
 		 359 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  36.57 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  32.37 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  31.55 
 
 		 381 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  29.39 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  33.13 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  32.62 
 
 		 363 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  29.38 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3092  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.25 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0510959  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2698  hypothetical protein  24.26 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.402222  normal  0.567569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  27.15 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2685  hypothetical protein  25.3 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5371  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  26.22 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2462  hypothetical protein  23.67 
 
 		 397 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1416  hypothetical protein  22.89 
 
 		 395 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2313  protein of unknown function DUF482  29.94 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0391405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2662  hypothetical protein  24.59 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.752873  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2995  hypothetical protein  27.46 
 
 		 437 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6855  Protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  27.43 
 
 		 354 aa  42.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>