19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3303 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  599  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  86.43 
 
 
298 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  74.83 
 
 
298 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  80.43 
 
 
319 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  80.43 
 
 
337 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  83.72 
 
 
337 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  83.53 
 
 
298 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  83.53 
 
 
300 aa  447  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  83.53 
 
 
298 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  42.41 
 
 
293 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  43.88 
 
 
297 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  44.62 
 
 
294 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  43.77 
 
 
292 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  42.86 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  38.56 
 
 
312 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  39.51 
 
 
318 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  26.48 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  23.11 
 
 
323 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03701  hypothetical protein  28.32 
 
 
276 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>