36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3861 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  100 
 
 
101 aa  206  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01009  hypothetical protein  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01002  modulator of CbpA co-chaperone  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1235  chaperone-modulator protein CbpM  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.589416  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2315  chaperone-modulator protein CbpM  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2125  chaperone-modulator protein CbpM  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459962  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2596  chaperone-modulator protein CbpM  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.370593 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1117  chaperone-modulator protein CbpM  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1111  chaperone-modulator protein CbpM  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2643  chaperone-modulator protein CbpM  65.35 
 
 
101 aa  142  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.813926  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  67.33 
 
 
101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  67.33 
 
 
101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  67.33 
 
 
101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  67.33 
 
 
101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  67.33 
 
 
101 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  42.71 
 
 
101 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  42.27 
 
 
101 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  41.24 
 
 
101 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  40.62 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  39.18 
 
 
101 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  40 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  35.42 
 
 
114 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  35.63 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  34.48 
 
 
101 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  37.93 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  28.05 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  30.95 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  31.58 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  31.58 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  34.18 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  34.18 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0262  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.143032  normal  0.721981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>