39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4921 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  265  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  41.01 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  40.56 
 
 
138 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  41.3 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  40.15 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  41.91 
 
 
128 aa  87.4  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  40.43 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  40.43 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  40.43 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  40.44 
 
 
136 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  40.14 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  35.88 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  43.18 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  38.98 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  35.38 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3461  hypothetical protein  45.74 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3235  hypothetical protein  45.74 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00764978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  34.35 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  39.1 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  35.21 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  41.18 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  47.19 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  47.25 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  40.96 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  48.15 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  35.38 
 
 
123 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  37.61 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  35.71 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  41.23 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  32.69 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13700  hypothetical protein  39.13 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  33.75 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  37.18 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  35.21 
 
 
105 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  39.8 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0476  putative integral membrane protein  31.51 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1583  hypothetical protein  36.09 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.228645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>