17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4392 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4392  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3107  Peptidase M23  51.75 
 
 		 304 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25342  normal  0.558977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.86 
 
 		 477 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3390  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  43.86 
 
 		 342 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5784  Membrane protein related to metalloendopeptidase- like protein  42.98 
 
 		 306 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159447  normal  0.0159463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6355  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.77 
 
 		 599 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6031  hypothetical protein  38.05 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.415177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  43.24 
 
 		 480 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8081  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.56 
 
 		 769 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.887421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8080  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.07 
 
 		 726 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4707  Peptidase M23  36.04 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.440213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5297  hypothetical protein  39.22 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2409  hypothetical protein  37.04 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2410  hypothetical protein  35.24 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.114407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5539  hypothetical protein  37.36 
 
 		 133 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5662  hypothetical protein  27.13 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.602875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2411  hypothetical protein  35.79 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0662721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>