48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3681 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3681  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.143848  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4646  hypothetical protein  74.18 
 
 
228 aa  324  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.045555  normal  0.138689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2856  hypothetical protein  62.9 
 
 
233 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0229131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0060  putative esterase/lipase  39.82 
 
 
235 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35630  hypothetical protein  36.28 
 
 
249 aa  115  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3905  esterase  36.24 
 
 
239 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1866  esterase  32.77 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.157989 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24510  hypothetical protein  27.43 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1935  alpha/beta hydrolase fold protein  34.22 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.985478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4058  putative esterase  30.42 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.792422  normal  0.0199888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3044  alpha/beta hydrolase fold protein  25.85 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3712  esterase EstC, putative  35.78 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3699  esterase EstC, putative  35.78 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3772  esterase EstC, putative  35.78 
 
 
256 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6933  hypothetical protein  27 
 
 
241 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4177  esterase EstC, putative  34.91 
 
 
261 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.10139  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2476  esterase EstC, putative  26.42 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1902  EstC  30.7 
 
 
235 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00691738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
235 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000242559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4323  esterase  27.35 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359116  normal  0.0128308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1718  hypothetical protein  26.05 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.205208  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5714  hypothetical protein  24.26 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4222  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4581  hypothetical protein  26.69 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.924033  normal  0.968498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4720  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2690  hypothetical protein  31.19 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.834952  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0526  hypothetical protein  32.04 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1008  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854645  normal  0.0281886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  26.53 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  24.37 
 
 
269 aa  46.2  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5015  Male sterility domain-containing protein  32.67 
 
 
667 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.435156  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3566  hypothetical protein  30.84 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370934  normal  0.0727224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3363  hypothetical protein  30.84 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286725  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5667  putative esterase  26.02 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6527  putative esterase  25.71 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.407204  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6978  putative secreted protein  24.26 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.304279  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7117  putative NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.72 
 
 
580 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0187299  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1601  hypothetical protein  26.92 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.488204  normal  0.0819094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0340  putative esterase  31.3 
 
 
241 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
260 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1509  putative secreted protein  24.26 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6320  putative secreted protein  24.26 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7175  hypothetical protein  29.82 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0154  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
260 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.06 
 
 
371 aa  42  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2864  alpha/beta hydrolase  26.21 
 
 
245 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>