More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3236 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3236  acetate kinase  100 
 
 
375 aa  726    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0533415  normal  0.013094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2971  acetate kinase  61.16 
 
 
361 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2195  acetate kinase  58.95 
 
 
358 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000385567  hitchhiker  0.000228017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1919  acetate kinase  60.71 
 
 
361 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1197  acetate kinase  51.25 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3545  acetate kinase  48.56 
 
 
433 aa  324  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0443913  normal  0.518352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1272  acetate kinase  57.56 
 
 
362 aa  322  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0858677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  41.67 
 
 
405 aa  314  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  40.55 
 
 
398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  42.57 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  41.21 
 
 
401 aa  311  9e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0522  acetate kinase  53.51 
 
 
344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.650195 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  41.6 
 
 
406 aa  309  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  39.8 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  41.73 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  42.18 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  41.94 
 
 
403 aa  306  3e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  41.31 
 
 
401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  49.04 
 
 
405 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  40.2 
 
 
398 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  40.81 
 
 
401 aa  301  9e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  44.59 
 
 
404 aa  301  9e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  40.55 
 
 
397 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  39.95 
 
 
398 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  40.25 
 
 
397 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  40.26 
 
 
397 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  41.45 
 
 
396 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  39.15 
 
 
408 aa  298  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  39.59 
 
 
396 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  38.52 
 
 
397 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  40.16 
 
 
397 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  39.9 
 
 
397 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  39.13 
 
 
395 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  43.95 
 
 
404 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  39.29 
 
 
398 aa  293  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  39.85 
 
 
397 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  44 
 
 
408 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  35.68 
 
 
404 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  42.39 
 
 
403 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0354  acetate kinase  45.54 
 
 
405 aa  293  3e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  293  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  39.85 
 
 
397 aa  292  6e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  39.59 
 
 
397 aa  292  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  37.84 
 
 
399 aa  292  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  43.34 
 
 
405 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  39.53 
 
 
400 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  39.53 
 
 
400 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  39.64 
 
 
417 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1221  acetate kinase  44.7 
 
 
394 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.805277  normal  0.0186268 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  39 
 
 
414 aa  286  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  46.89 
 
 
395 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  37.76 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  37.44 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  37.76 
 
 
398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  48.91 
 
 
381 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7970  acetate kinase  43.95 
 
 
378 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  37.37 
 
 
397 aa  276  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  43.65 
 
 
399 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  44.47 
 
 
583 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  42.47 
 
 
593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  42.93 
 
 
380 aa  272  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  37.78 
 
 
397 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  35.68 
 
 
404 aa  270  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4986  acetate kinase  47.3 
 
 
372 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  38.18 
 
 
401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  42.6 
 
 
401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  36.82 
 
 
402 aa  269  7e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  43.89 
 
 
772 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  42.99 
 
 
404 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  37.73 
 
 
398 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  38.69 
 
 
398 aa  267  2e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  36.63 
 
 
404 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  38.32 
 
 
397 aa  268  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  38.1 
 
 
399 aa  266  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3761  acetate kinase  44.8 
 
 
386 aa  265  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4397  acetate kinase  43.77 
 
 
398 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.59 
 
 
589 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  36.6 
 
 
399 aa  264  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  37.44 
 
 
402 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  35.28 
 
 
394 aa  263  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  43.42 
 
 
385 aa  263  3e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  38.76 
 
 
404 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  38.76 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  38.76 
 
 
404 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  38.76 
 
 
404 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  42.5 
 
 
411 aa  262  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  38.76 
 
 
404 aa  262  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3369  acetate kinase  46.74 
 
 
363 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.564026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  37.53 
 
 
395 aa  262  6e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  33.84 
 
 
394 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3693  acetate kinase  46.77 
 
 
371 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  36.11 
 
 
396 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  38.92 
 
 
397 aa  261  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  37.12 
 
 
398 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4073  acetate kinase  47.96 
 
 
375 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0369038 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>