More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5329 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009621  Smed_5329  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
322 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.780994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2497  alcohol dehydrogenase  70.5 
 
 
368 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0063447  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  69.57 
 
 
322 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4143  alcohol dehydrogenase  71.43 
 
 
322 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00967604  normal  0.0463972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3671  alcohol dehydrogenase  71.43 
 
 
322 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.15 
 
 
327 aa  299  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.83 
 
 
315 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3308  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.77 
 
 
321 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000692795  normal  0.0484159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16020  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  44.82 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5178  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.99 
 
 
323 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3438  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.58 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.661509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7387  putative quinone oxidoreductase  45.99 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7384  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.21 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2197  putative quinone oxidoreductase  45.57 
 
 
323 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.51788  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0232  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.57 
 
 
323 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1920  putative quinone oxidoreductase  45.57 
 
 
323 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1683  quinone oxidoreductase, putative  45.57 
 
 
323 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1221  putative quinone oxidoreductase  45.57 
 
 
331 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.908544  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0233  quinone oxidoreductase  45.54 
 
 
323 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0935  putative quinone oxidoreductase  45.57 
 
 
331 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0322  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  45.26 
 
 
331 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  44.89 
 
 
322 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.64 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2374  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.73 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.220346  normal  0.0293571 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1039  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.37 
 
 
321 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  43.21 
 
 
322 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2517  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.9 
 
 
321 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0419474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2572  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  43.83 
 
 
319 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 
322 aa  233  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.86 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01030  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  40.73 
 
 
325 aa  232  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5040  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.12 
 
 
323 aa  232  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13939  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5019  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.28 
 
 
317 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0480145  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2184  NADPH:quinone reductase, zeta-crystallin homolog oxidoreductase protein  41.98 
 
 
324 aa  230  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200214  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  40.31 
 
 
321 aa  229  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3010  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.52 
 
 
322 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1766  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40.31 
 
 
321 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0377504  normal  0.772625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3286  quinone oxidoreductase  39.69 
 
 
321 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.635243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3544  quinone oxidoreductase  39.69 
 
 
321 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.752673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3512  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40 
 
 
321 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3193  alcohol dehydrogenase  40.62 
 
 
321 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
325 aa  225  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3109  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.44 
 
 
322 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.44 
 
 
322 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3501  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  39.69 
 
 
321 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.74 
 
 
320 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3200  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  40 
 
 
321 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3256  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  39.38 
 
 
321 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2503  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.67 
 
 
327 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.731792  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2381  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.05 
 
 
326 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722017  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1821  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  44.14 
 
 
322 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00168562  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1981  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.74 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2472  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
325 aa  222  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.439289  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3228  alcohol dehydrogenase  43.34 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0571  quinone oxidoreductase  40.18 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0988  alcohol dehydrogenase  41.36 
 
 
324 aa  219  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3483  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  40 
 
 
321 aa  219  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.265979  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3633  alcohol dehydrogenase  39.88 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1640  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.56 
 
 
324 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.140848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4272  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.05 
 
 
323 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2206  alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
324 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889298  normal  0.771237 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5617  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.23 
 
 
324 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0414164  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2328  alcohol dehydrogenase  42.28 
 
 
324 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3903  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221632  normal  0.178635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.74 
 
 
323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.313231 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.89 
 
 
320 aa  215  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3255  putative NADPH-quinone reductase  40.37 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.18 
 
 
324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3620  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  39.2 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1678  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.05574  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2290  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2313  alcohol dehydrogenase  40.74 
 
 
324 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.730105 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.75 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1325  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.55 
 
 
327 aa  212  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1191  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.25 
 
 
323 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0548  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.18 
 
 
324 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.967786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1019  quinone oxidoreductase  39.51 
 
 
324 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.527544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5388  alcohol dehydrogenase  40 
 
 
326 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  38.77 
 
 
325 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1305  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  39.57 
 
 
324 aa  208  8e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263394  normal  0.0862174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1582  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.56 
 
 
324 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.45945  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00158  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11430)  36.39 
 
 
332 aa  207  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1419  alcohol dehydrogenase  37.12 
 
 
325 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173478  normal  0.0573079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1644  alcohol dehydrogenase  39.81 
 
 
325 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1238  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.58 
 
 
324 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1879  quinone oxidoreductase  38.58 
 
 
324 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0458768  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1245  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  38.58 
 
 
324 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0363  quinone oxidoreductase  38.58 
 
 
324 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0787  quinone oxidoreductase  38.58 
 
 
324 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 
321 aa  205  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1080  quinone oxidoreductase  38.58 
 
 
324 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169344  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  37.12 
 
 
326 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.317199  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1391  quinone oxidoreductase  38.58 
 
 
324 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2060  alcohol dehydrogenase  38.58 
 
 
324 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  0.174232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3049  quinone oxidoreductase, putative  39.33 
 
 
331 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.658374  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1170  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.12 
 
 
331 aa  204  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.636549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5020  alcohol dehydrogenase  38.39 
 
 
321 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00109136  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2114  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 
322 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76358  decreased coverage  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2985  alcohol dehydrogenase  40.25 
 
 
323 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1928  alcohol dehydrogenase  35.84 
 
 
337 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00329815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>