19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4072 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4072  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1797  hypothetical protein  46.67 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.71846  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1986  hypothetical protein  44.07 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0312653  hitchhiker  0.00472335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  43.97 
 
 		 561 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3817  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0215  hypothetical protein  39.2 
 
 		 294 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1869  hypothetical protein  39.06 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3629  hypothetical protein  38.28 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3210  hypothetical protein  33.53 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3611  hypothetical protein  52.38 
 
 		 281 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0738  hypothetical protein  41.86 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5578  hypothetical protein  49.15 
 
 		 198 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3958  hypothetical protein  46.03 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4579  hypothetical protein  29.25 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.324475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0005  hypothetical protein  30.77 
 
 		 332 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0817  hypothetical protein  49.12 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.470186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0776  hypothetical protein  49.12 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0833478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7022  hypothetical protein  31.36 
 
 		 345 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00344317  hitchhiker  0.00000183112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4757  hypothetical protein  27.91 
 
 		 395 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311198  normal  0.483152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>