41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0249 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0249  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 315 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0668942  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.68 
 
 		 316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0726  flagellar motor switch protein  48.51 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0344  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.68 
 
 		 316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566243  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0304  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.09 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  23.37 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  24.75 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  24.24 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  24.24 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.24 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  20.59 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.08 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  24.9 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.43 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  23.14 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  19.51 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  21.43 
 
 		 329 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.2 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  22.64 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  25.22 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  27.87 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  27.87 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  27.87 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  22.35 
 
 		 329 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 342 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  28.16 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  22.06 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  24.3 
 
 		 343 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  24.56 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  26.27 
 
 		 332 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  24.3 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  24.3 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  27.35 
 
 		 332 aa  42.7  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1333  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.77 
 
 		 181 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  23.81 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  25.21 
 
 		 338 aa  42.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  24.3 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>