42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6615 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6615  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
356 aa  744    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3087  MORN repeat-containing protein  43.48 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250081  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3034  MORN repeat-containing protein  41.3 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2389  MORN repeat-containing protein  40 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1594  MORN repeat-containing protein  39.56 
 
 
500 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.291295  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2559  MORN repeat-containing protein  36.63 
 
 
216 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0849  MORN repeat-containing protein  32.99 
 
 
538 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.10958  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1887  PEGA domain-containing protein  32.69 
 
 
461 aa  57.4  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0600  MORN repeat-containing protein  37.5 
 
 
468 aa  57  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347615  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3530  MORN repeat-containing protein  30.95 
 
 
202 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal  0.364919 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2332  hypothetical protein  40.66 
 
 
501 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1007  MORN repeat-containing protein  40.66 
 
 
501 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_944  predicted protein  32.22 
 
 
107 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3811  MORN repeat-containing protein  35.92 
 
 
577 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481071  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34720  predicted protein  32.32 
 
 
576 aa  56.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3345  MORN motif-containing protein  34.91 
 
 
507 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11352  predicted protein  37.08 
 
 
211 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0412501  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1093  hypothetical protein  35.8 
 
 
579 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0551  MORN domain-containing protein  34.31 
 
 
642 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1013  MORN motif-containing protein  34.07 
 
 
245 aa  53.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0633058  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0590  MORN repeat-containing protein  34.31 
 
 
603 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0596  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  35.29 
 
 
577 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0772523 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_850  predicted protein  34.44 
 
 
662 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.433034 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10974  predicted protein  31.19 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0733  MORN repeat family protein  34.34 
 
 
575 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0236191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0603  peptidase C13, legumain asparaginyl peptidase  35.35 
 
 
577 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0634  MORN motif-containing protein  36.26 
 
 
575 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_95034  predicted protein  34.67 
 
 
505 aa  50.8  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.234943  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2279  hypothetical protein  35.48 
 
 
500 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.416244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11900  hypothetical protein  36.25 
 
 
579 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.55763  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10781  predicted protein  32.97 
 
 
160 aa  49.7  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0654  phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase  25.17 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.21704  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4983  hypothetical protein  35.35 
 
 
575 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291511  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19094  predicted protein  32.11 
 
 
226 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.762529  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0854  MORN repeat-containing protein  36.67 
 
 
488 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133708  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0051  MORN motif-containing protein  41.18 
 
 
126 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000239093  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93578  predicted protein  30 
 
 
686 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000533165  normal  0.01596 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30154  predicted protein  33.75 
 
 
172 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.82692  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1911  hypothetical protein  40.68 
 
 
136 aa  44.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_24687  predicted protein  31.58 
 
 
730 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.818146  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2296  hypothetical protein  32.91 
 
 
106 aa  43.5  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000811573  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26666  predicted protein  35.29 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>